Los antithrombóticos disponibles actualmente presentan una serie de limitaciones, como la ventana terapéutica estrecha y el sangrado que, asociados a la alta prevalencia de enfermedades relacionadas con la hemostasia, hacen necesaria la investigación, diseño y descubrimiento de nuevos compuestos bioactivos. En este contexto, el grupo BIO-HPC (Bioinformatics and High Performance Computing Research Group, http://bio-hpc.eu) del UCAM, Murcia - España, ha descubierto previamente un compuesto original (TMI), capaz de modular la antitrombina. Este descubrimiento, basado en la experiencia del grupo con el análisis virtual, originó una colaboración con GBE (Grupo de Bioinformatica Estrutural, http://www.ufrgs.br/bioinfo/), Porto Alegre - Brasil, para acceder a las dinámicas de la modulación del receptor blanco por TMI.

Ante estos resultados previos, la presente propuesta tiene como objetivo profundizar la complementariedad entre los grupos, permitiendo un desarrollo más rápido de nuevos posibles agentes antithrombóticos, derivados del escafocromo TMI o de patrones estructurales nuevos. Durante el pasantía, se espera refinar las anteriores búsquedas virtuales utilizando una restricción farmacofórica, basada en ambos espacios conformacionales complejos de AT y TMI, empleando la forma plasmática, glicosilada, de AT. Además, evaluar la capacidad de los compuestos seleccionados en promover una activación conformacional de AT, alimentando un ciclo virtuoso de optimización de moléculas y modelos capaces de ofrecer nuevas entidades químicas, posibles compuestos terapéuticos originales.

Para respaldar estos cálculos, se empleará la infraestructura de supercomputadoras tanto en Murcia como en Brasil.