El estudio de la dinámica conformacional de péptidos y proteínas es uno de los principales problemas científicos de nuestro tiempo. No en vano, es la herramienta fundamental con la que estas moléculas desempeñan su acción biológica.

Existe además un evidencia científica creciente de que las transiciones conformacionales de las proteínas se ven afectadas significativamente por los flujos de energía vibracionales que tienen lugar a lo largo de la cadena peptídica, que pueden llegar a actuar como transmisores de información entre distintos puntos o residuos de la misma.

Las técnicas experimentales disponibles hoy en día, aunque sofisticadas, no permiten cartografiar claramente dichos flujos de energía, y solo proporcionan una información parcial y muy limitada de los mismos.

En este contexto, los métodos de la química teórica y computacional ofrecen un enfoque complementario que aspira a desvelar las dinámicas vibracional y conformacional de estas moléculas a escala atómica.

Teniendo en cuenta estos resultados, proponemos en este proyecto de estancia de investigación del Dr. Soler el estudio de los mecanismos de cambio conformacional de péptidos en disolución que tienen lugar de forma espontánea en el equilibrio.

En ausencia de perturbaciones externas, tales como pulsos IR, visible-UV o T-jump, la transición conformacional del péptido tiene lugar a través de la transferencia de energía vibracional entre la biomolécula y las moléculas de agua de su entorno.

Para ello emplearemos la técnica de análisis de modos normales instantáneos, desarrollada por el grupo receptor, y adaptaremos los algoritmos de evaluación conformacional desarrollados por el Dr. Soler para sus trabajos de plegamiento proteíco al programa de análisis de flujos de energía.

Nuestro objetivo pasa por identificar los modos vibracionales del péptido responsables de los mayores cambios conformacionales, determinar los mecanismos que controlan dichos cambios, así como el grado de selectividad y rendimiento de los mismos, con el fin de establecer las bases teóricas para el desarrollo de técnicas experimentales para el estudio de los cambios conformacionales en moléculas peptídicas.