Para el año 2030, se estima el diagnóstico de aproximadamente 9 millones de casos con enfermedad de Párkinson, lo que supondrá un impacto económico de billones de euros. Por ello, hay una necesidad inmediata de apoyar la búsqueda de nuevas estrategias terapéuticas que retrasen el inicio y el desarrollo de esta enfermedad.

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Actualmente, los métodos más prometedores para la investigación en enfermedades neurodegenerativas son los estudios de asociación del genoma (GWAS) y los análisis del transcriptoma. Mediante estos estudios se han identificado loci de riesgo y, más recientemente, loci relacionados con la edad de inicio o progresión de la enfermedad. El éxito de estos análisis radica en su naturaleza no sesgada que permite identificar nuevos mecanismos involucrados en la enfermedad.

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Sin embargo, todavía poseen ciertas limitaciones relacionadas con el muestreo o la manipulación de los datos transcriptómicos disponibles en las diferentes bases de datos. En el grupo de investigación liderado por la Dr Mina Ryten del University College London enfocan sus esfuerzos en desarrollar nuevas estrategias para mejorar estos análisis. En sus trabajos más recientes, combinan datos obtenidos de análisis transcriptómico masivo y análisis transcriptómico específico de células permitiendo una mejora en la interpretación de los resultados.

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Objetivos del Proyecto

Así, este proyecto tiene como principal objetivo integrar diferentes modelos de co-expresion génica para investigar los mecanismos moleculares involucrados en la progresión de la enfermedad de Párkinson. Para esta finalidad, planteamos una metodología innovadora basada en la integración de modelos de co-expresión procedentes del análisis transcriptómico masivo, del análisis transcriptómico específico de células y del análisis de factores de transcripción y sus conjuntos de genes regulados. El resultado será la creación de una meta-red que nos permitirá:

1. (i) describir las interacciones y mecanismos de regulación de los genes de riesgo,
2. (ii) identificar las regiones del cerebro donde se expresan y
3. (iii) determinar las poblaciones celulares de interés.

Además, utilizaremos los datos obtenidos para realizar predicciones y validaciones in silico con el objetivo de crear una lista de genes como posibles dianas terapéuticas. En definitiva, el desarrollo de este proyecto mejorará la metodología actual basada en la integración de estos análisis proporcionando nuevas perspectivas en la investigación de los procesos neurodegenerativos de la enfermedad de Parkinson.