Con la presente propuesta se pretende protocolizar metodología de secuenciación masiva de ADN asociada a la restricción de doble digestión (ddRAD), un método rápido y fiable para la genotipificación por secuenciación, ya que se selecciona un fragmento de ADN genómico y también utilizado para el descubrimiento de SNP, todo ello se analiza mediante software para analizar datos RAD. Para poder culminar con nuestro estudio, el paso final sería el ensamble de todo este trabajo, para ello procedemos a un estudio de asociación de genoma completo (GWAS), para asociar variaciones genéticas específicas con ciertas enfermedades.

Es un método que implica el análisis de los genomas de muchos individuos diferentes de Corvina y la búsqueda de marcadores genéticos que se pueden utilizar para predecir la presencia de una enfermedad o patógeno. Una vez que dichos marcadores genéticos son identificados, se pueden utilizar para entender cómo los genes contribuyen a la enfermedad y desarrollar mejores estrategias de prevención y tratamiento.

Objetivos primarios

1. Secuenciación de los individuos. Esto implica la construcción de bibliotecas de secuenciación de ADN asociado a sitios de restricción de doble digestión (ddRAD) para algunos cientos de corvina (Argyrosomus regius) y sus padres. Alternativamente, la paternidad se realizará mediante el uso de marcadores microsatélites.
2. Los datos de la progenie anterior (ya sea SNP o microsatélites) se analizarán a través de tuberías bioinformáticas para inferir la asignación de paternidad.
3. Una vez que se realice la asignación de paternidad, se ejecutarán los análisis GWAS posteriores.