Las infecciones parasitarias por helmintos suponen hoy en día uno de los mayores problemas relacionados con la salud animal y producción ganadera, sobre todo en ganado ovino, ya que el pastoreo extensivo es uno de los factores de riesgo principales para la transmisión de estas especies parasitarias. En el hospedador ovino, las coinfecciones con distintas especies de nematodos son frecuentes, variando estas especies, tanto en su patogenicidad y epidemiología como en la sensibilidad que presentan frente a los fármacos antihelmínticos.

En los últimos años, la aplicación de la secuenciación profunda de amplicones, también denominada next generation sequencing (NGS) o "nemabioma" gastrointestinal para estudiar las comunidades de nematodos parásitos en hospedadores rumiantes, ha supuesto un salto cualitativo en el diagnóstico de helmintosis.

Proyecto REVERDEMUR

En este proyecto se pretende aplicar la tecnología de secuenciación profunda de amplicones en muestras de animales de pastoreo presentes en Irlanda, donde los problemas de resistencias antihelmínticas son frecuentes. Esta tecnología supone un salto cualitativo a la comprensión de la ecología de los parásitos y las relaciones parásito-hospedador, pero además, puede ser una herramienta de gran utilidad para estudiar la respuesta a los tratamientos farmacológicos y la posible aparición de resistencias de las poblaciones de parásitos en los programas de control utilizados en ganadería.