Bucles-R en la reprogramación transcripcional de las plantas asociada con la infección viral
Los bucles-R son estructuras tricatenarias del DNA cromatínico que comprenden una molécula de DNA de cadena sencilla y un dúplex híbrido RNA/DNA. Los bucles-R están ampliamente distribuidos en los genomas, y tienen funciones esenciales en múltiples procesos celulares y en enfermedades. Los estudios realizados en plantas son muy escasos, pero también indican que la dinámica de los bucles-R tiene un papel fundamental en la regulación de la expresión de los genes de estos organismos.
Las RNAsas de tipo H1, junto con helicasas, son enzimas con papeles fundamentales, aunque escasamente caracterizados, en la resolución de los bucles-R. Las hipótesis de trabajo de este proyecto son:
- (1) El patrón de bucles-R de tomate muestra una serie de cambios dinámicos durante la infección viral, de manera similar a lo que ocurre con Arabidopsis en situación de estrés abiótico.
- (2) Las RNasas H1 de tomate, en particular la RNasaH1_B1, tienen un papel importante en la dinámica de los bucles-R de tomate, tanto en plantas sanas como infectadas con virus.
Teniendo en cuenta los antecedentes inmediatos del proyecto, de los cuales el más destacable es que, una de las proteínas de movimiento, la TGB1, del virus del mosaico del pepino dulce (PepMV) interacciona con la RNasaH1_B1 de tomate, los objetivos que se proponen para este proyecto son los siguientes:
- (1) Analizar la unión a RNA y la actividad nucleasa de la RNasaH1_B1 de tomate.
- (2) Estudiar la localización subcelular de la RNasaH1_B1 de tomate y de TGB1 en células sanas e infectadas con PepMV.
- (3) Determinar el patrón genómico de bucles-R de tomate en plantas de tipo silvestre y mutantes defectivos en RNAasas H1, sanas e infectadas con PepMV.
El proyecto tiene por tanto un excelente potencial para generar información, de tipo fundamental, para entender el control de la expresión de genes del huésped en condiciones de infección por virus. En el largo plazo, el proyecto puede contribuir a identificar dianas para la mejora biotecnológica en las resistencias de las plantas a virus.