Enlace de modelos de representación semántica de conocimiento clínico e integración de datos clínicos en repositorios semánticos.
Mi trabajo doctoral hace uso de estándares de modelo dual para la representación e intercambio de historias clínicas electrónicas que separa información y conocimiento. A nivel de representación de conocimiento clínico, trabajamos con la noción de arquetipo y hacemos uso de ontologías para la formalización semántica. El grupo receptor desarrolla investigaciones en el ámbito de la Informática Médica, haciendo uso de estándares y tecnologías semánticas. En la actualidad están trabajando con Clinical Element Model (CEM). CEM es una estrategia diseñada para representar modelos lógicos de elementos de datos clínicos de manera que la representación, interpretación y compartición de los datos entre fuentes heterogéneas se haga de forma inequívoca. Por tanto, CEM se puede ver como una alternativa o propuesta complementaria al uso de arquetipos para la representación del conocimiento clínico.
El grupo receptor ha desarrollado un modelo OWL del Clinical Element Model (CEM), por lo que realiza una apuesta de formalización tecnológica de la semántica clínica similar a la nuestra, de ahí que surja el interés por conocer el trabajo que están realizando, aprender de su visión práctica y clínica y unir los resultados de ambos esfuerzos. Por ello, la investigación a realizar durante la estancia se centrarán en este dominio de investigación, haciendo uso de las tecnologías de la Web Semántica para realizar las siguientes actividades.
- Estudio de CEM: Se procederá a estudiar el modelo CEM usado por el grupo receptor. Tiempo estimado: 2 semanas
- Enlace CEM-arquetipo: El grupo de origen ha desarrollado modelos OWL para los estándares de historia clínica electrónica (HCE) openEHR e ISO13606, por lo tanto, se trabaja con una representación OWL de los arquetipos, y el grupo receptor ha desarrollado modelos OWL para CEM. En la actualidad el grupo receptor está trabajando en una actualización de dicho modelo OWL de CEM. El objetivo de esta tarea será desarrollar una representación semántica que permita enlazar ambas representaciones, con el fin de facilitar la interoperabilidad semántica entre modelos CEM y arquetipos. Tiempo estimado: 1 mes
- Integración de datos en repositorios semánticos: Una vez comunicados los arquetipos y los modelos CEM se trabajará en poder integrar datos procedentes de modelos CEM con datos arquetipados. Para ello se extenderá el sistema de integración de datos que forma parte de mi tesis doctoral, y se harán pruebas que verifiquen su correcto funcionamiento. Tiempo estimado: 1,5 meses
- Desarrollo de métodos de consulta semánticos: Los repositorios semánticos resultado de las actividades anteriores requieren el desarrollo de métodos de consulta que exploten sus beneficios para su utilización en aplicaciones clínicas. Por ello en esta estancia se desarrollarán y validarán nuevos métodos de consulta semánticos. Tiempo estimado: 1 mes
- Desarrollo de informe y artículos de investigación: Se procederá a dar difusión al trabajo realizado con la redacción de informes y artículos de investigación. Esta tarea se realizará a lo largo de los 4 meses de estancia, si bien el paso de la redacción de informes será mayor al principio y la de artículos al final.