Plan de actuación séneca 2013 programa ¿jóvenes líderes en investigación¿; título del proyecto "desarrollo en arquitecturas computacionales masivamente paralelas de una metodología para el descubrimiento y optimización de compuestos bioactivos y su aplicación a problemas de relevancia biológica"
Uno de los problemas científicos más importantes actualmente es el descubrimiento de nuevos compuestos bioactivos para problemas de relevancia biológica o donde los compuestos conocidos previamente no son lo suficientemente efectivos. Tradicionalmente ha sido la Industria Farmacéutica quien se ha ocupado del estudio de dichos problemas, debido al gran coste económico que implica y a sus dificultades técnicas.
Desde hace unas dos décadas existen otras metodologías basadas en el modelado molecular que permiten acelerar dichos descubrimientos, y que pueden ser desarrolladas de manera eficiente en un entorno académico a un coste mucho menor. El solicitante de este proyecto ha demostrado previamente que es posible acelerar drásticamente mediante simulación por ordenador dichos procesos de descubrimiento de compuestos bioactivos, cuando se mezcla una investigación multidisciplinar (Química, Biología, Informática, Ingeniería, Medicina) con la explotación de supercomputadores y arquitecturas paralelas de alto rendimiento (GPUs).
No obstante, tanto esta metodología como otras usadas dentro del mismo campo por decenas de miles de investigadores todavía contienen una serie de limitaciones a nivel de capacidad predictiva y de velocidad de proceso de datos, dos factores de extrema relevancia para poder llevar a cabo con éxito este tipo de proyectos. El solicitante ha identificado cuales son las limitaciones más relevantes actualmente de dichos métodos y propone en este proyecto como solucionarlas, partiendo principalmente de resultados previos ya obtenidos en trabajos previos suyos.