Explotación flexible de información integrada sobre proteínas
La investigación en Ciencias de la Vida requiere del uso de volúmenes ingentes de datos que están distribuidos o son proporcionados por una gran variedad de bases de datos y herramientas heterogéneas, no existiendo ninguna que aporte una visión integrada de una serie de aspectos de interés general para la comunidad investigadora y que, por tanto, podría ayudar a millones de investigadores a reducir el tiempo necesario en la formulación de hipótesis de investigación. La investigación basada en el uso independiente de los distintos recursos y herramientas presenta no sólo el inconveniente de requerir más tiempo de los investigadores para la recopilación de la información, sino que siempre existe el riesgo de que los investigadores no conozcan las herramientas y bases de datos más relevantes y esto les haga no tener en cuenta información de interés. Consultar de forma independiente cada recurso es una tarea anodina puesto que cada recurso te obliga a visualizar toda la información disponible para cada molécula, por lo que el investigador no recibe únicamente la información que le interesa y tiene que explorar obligatoriamente información superflua para una investigación concreta. Por otro lado, hay que tener en cuenta que no se trabaja con unas pocas proteínas o genes, sino que se comparan con muchos otros, o se hacen búsquedas entre todos los genes o proteínas para buscar posibles relaciones, lo que multiplica la tarea a realizar actualmente de forma manual.
Mediante este proyecto se va a desarrollar un sistema que automatice este proceso de gestión de información y su integración con herramientas de análisis bioinformático relevantes para las tareas más generales de soporte a la formulación de hipótesis de investigación. Esta plataforma no permitirá únicamente lanzar la aplicación y buscar todos los genes o proteínas deseados en una única ejecución, sino que deberá ser capaz de proporcionar mecanismos de personalización de la información a explorar y las herramientas a utilizar para ajustarse a distintos objetivos de investigación.