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Leer más sobre Identificación de selección positiva en la abeja ibérica (Apis mellifera iberiensis) mediante secuenciación del genoma completo

Resumen:

Descifrar la base genética del proceso de adaptación de los organismos ha sido y es uno de los objetivos fundamentales de la biología evolutiva. En el contexto actual de ¿crisis ambiental global¿, causado principalmente por la acción humana, nunca antes esta meta fue tan crucial, ya que permitirá realizar predicciones sobre cómo los organismos pueden responder ante transformaciones aceleradas del medio ambiente.

Esta cuestión es particularmente importante para la abeja melífera (Apis mellifera Linnaeus 1758) cuya función polinizadora tanto de cultivos agrícolas como de flora silvestre posee un elevado valor ambiental y económico (estimado en 153 billones de euros. Actualmente, las abejas melíferas se enfrentan a presiones cada vez mayores como resultado del uso intensivo del paisaje (principalmente pesticidas), el cambio climático y a la propagación de plagas y enfermedades tanto naturales como introducidas que han ocasionado el aumento de la pérdida de colmenas durante la última década.

Los recientes avances en el campo de la secuenciación del ADN (secuenciación de genomas completos, whole-genome sequencing en inglés, WGS) y el desarrollo de las herramientas genómicas, estadísticas y computacionales permitirán en los próximos años la generación de los recursos necesarios para estudiar la variación genética de las abejas melíferas a gran escala para la búsqueda e identificación en todo el genoma de las señales de selección con una resolución y profundidad sin precedentes.

En este proyecto, voy a realizar el análisis de los datos de la secuenciación del genoma completo (WGS) de 120 individuos pertenecientes a poblaciones de abejas ibéricas (Apis mellifera iberiensis) y otras subespecies de abejas de referencia. Realizaré un ensayo sobre las mutaciones segregantes de las poblaciones, lo que proporcionará un mayor poder en la detección de la selección positiva y en la identificación de las posibles mutaciones causales. El conjunto de datos de WGS lo examinaré utilizando una batería de herramientas genómicas y subgenómicas basadas en diferentes métodos: ¿site frequency spectrum¿, desequilibrio de ligamiento, subdivisión poblacional, y estructura de los haplotipos.

Con este potente set de datos (WGS) y con los análisis implementados en este proyecto podre testar diversas hipótesis sobre el origen de Apis mellifera iberiensis, realizar un mapa genómico completo de la selección positiva y utilizar dichos datos para estudiar y entender cómo responden las abejas melíferas ante los cambios ambientales, lo cual proporcionará una base científica para la conservación de la diversidad genética de Apis mellifera.

Fuente:

Beca

Tipo de Noticia:

Entrevista de 23 minutos

Protagonista:

Irene Muñoz Gabaldón

Tlf. Contacto:

657114991

E-mail Contacto:

irenemg@um.es

Fecha redacción:

Lunes, 12 Enero, 2015

Fecha estimada:

Lunes, 12 Enero, 2015

Fecha emisión:

Viernes, 16 Enero, 2015

Observaciones:

Posdoctoral de la Fundación Séneca

Palabras clave:

PD, fundacion seneca, abejas, ADN

Emisión confirmada: