Región de Murcia
Fundación Séneca
FSE

Identification of novel genes involved in Petunia flower development using transcript profiling and reverse genetics

Nace en Alicante en 1984. En 2007 obtiene la licenciatura en Biología por la Universidad de Murcia con premio extraordinario fin de carrera. A continuación cursa el máster en Técnicas Avanzadas en Investigación y Desarrollo Agrario y Alimentario en la Universidad de Politécnica de Cartagena obteniendo el título, con premio extraordinario, en 2008. Durante 2007 y 2008 disfruta de una beca de especialización en el marco del proyecto de genómica de tomate (Genoma España), y en este último año obtiene una beca-contrato predoctoral propia de la Universidad Politécnica de Cartagena. En el año 2009 inicia una beca de la Fundación Séneca para realizar la tesis doctoral en la misma Universidad, donde participa en actividades docentes durante el curso académico 2009/10. Es investigadora en el proyecto que acoge su propuesta de tesis (Fundación Séneca, 11895/PI/09); así como en el de mejora del tamaño floral en Antirrhinum majus (Ministerio de Educación y Ciencia, AGL2007-61384), y de genómica funcional de tomate (Genoma España). Ha realizado una estancia externa en la Universidad de Verona (Italia) en 2011. En la actualidad estudia la Ingeniería Técnica en Informática de Sistemas, de la que ha superado dos tercios. Posee tres publicaciones en revistas científicas de primer cuartil y ha participado en cuatro congresos, tres de ellos internacionales. Posee un nivel avanzado en inglés e intermedio en francés.

Resumen de tesis

Petals are a key element on plant life cycle as, in many species, they attract pollinators, thus aiding to reproduction. Furthermore, they have economic importance in ornamental crops. In the present study, petal transcriptional patterns were compared within the flower organs in Arabidopsis thaliana. It was found that catalytic molecular functions were overrepresented in
petals. A shortlist comprising the top ten differentially expressed genes in petals were mapped to the model species with industrial value Petunia hybrida, and further downregulated by RNAi. The silencing phenotypes found permitted to assign functions in petal
development to seven novel genes: when silenced, they triggered alterations on flower size and shape (PhCYP76, PhNPH3, PhFeSOD, PhXTH, PhCYP96 and PhWAK), petal smoothness (PhPRA), color (PhNPH3 and PhWAK ) and symmetry
(PhCYP76 ). Pleiotropic phenotypes were found, such as changes in root morphology and leaf color (PhCYP76 ), flower number, capsule and seed morphology (PhCYP96 ) and plant height (PhCYP76 and PhCYP96 ).

To accomplish the experimental design, three methods were developed. First, the “pESTle” management system that assembles, annotates, stores and serves expressed sequence tag data. Second, a reference gene selection for real time PCR experiments that includes a new method for stability estimation based on rank aggregation of published algorithms, and concludes that a normalization
factor with two members of EF1α, SAND, CYP or RAN1 is stable enough under most conditions. And third, a PCR efficiency estimator based on amplicon characteristics which allows efficiency-driven primer design in a Web tool.

Área de conocimiento

Biología vegetal

Grupo de investigación

Genética
Director: Marcos Egea Gutiérrez-Cortines
Codirector: Julia Weiss

Programa de doctorado

Técnicas avanzadas en investigación y desarrollo agrario y alimentario

Período de Actividad

01/01/2009 - 14/07/2012

Estado de tesis

Defendida

Estancias anteriores

Ha realizado en 2011 una estancia externa en la Universidad de Verona (Italia) bajo la supervisión del Prof. Dr. Mario Pezzotti para realizar estudios transcriptómicos en petunia mediante micromatrices de ADN.

Aviso legalPolítica de privacidad