Región de Murcia
Fundación Séneca
FSE

Genética y genómica para la adaptación de frutales al cambio climático

Nace en Bullas en 1980. En 2001 obtiene el título de Ingeniero Técnico Agrícola y el Premio Extraordinario Fin de Carrera. En 2003 obtiene el título de Ingeniero en Agronomía, y en 2007 el DEA por la Universidad de Politécnica de Cartagena. En 2010 obtiene el Master en Dirección de Empresas Agroalimentarias y Márketing Agrario, por la Universidad Politécnica de Valencia. Entre 2005 y 2009 desarrolló su proyecto de tesis doctoral en el departamento de Mejora Vegetal del CEBAS-CSIC, bajo la dirección de los Dr. José Egea Caballero y David Ruiz González, obteniendo el grado de doctor en 2009 por la Universidad de Politécnica de Cartagena.  Durante este periodo disfruta de una beca-contrato de Formación de Personal Investigador (2005-2009). Mientras desarrolló la tesis doctoral realizó estancias investigadoras en la Universidades de Pisa (Italia), Stellenbosch University y Western Cape University (Sudáfrica) y Plant and Food Research (Nueva Zelanda). Posteriormente trabaja durante un año en el CEBAS-CSIC. En el año 2010 obtuvo una beca de la Fundación Séneca para realizar una estancia posdoctoral investigado acerca de la genética para la aclimatación climática en el Instituto de INRA-Bordeaux con la Dra. Elisabeth Dirlewanger. Obtiene el Premio Extraordinario de Doctorado en 2010 y, en 2012, el Premio Jóvenes Investigadores de la Sociedad Española de Ciencias Hortícolas, ambos por su tesis doctoral. Posee comunicaciones en numerosos congresos nacionales e internacionales, así como publicaciones científicas en revistas de carácter nacional e internacional (16 JCR -12 de ellas como primer o último autor). Domina el inglés, francés, italiano.


Resumen del proyecto de investigación

Este proyecto está basado en la incorporación del candidato al centro de investigación INRA-UREF (Unité de Recherche sur les Espèces Fruitières) con el objetivo de profundizar en el conocimiento de la determinación genética de los procesos fenológicos que influencian el letargo y la floración en cerezo. Los principales objetivos del proyecto son: (i) detección robusta de QTLs asociados a las necesidades de frío y calor dentro de dos poblaciones para el mapeo, (ii) genotipado masivo de genes candidatos, de los que se conoce su intervención en numerosas rutas bioquímicas y metabólicas del proceso de letargo y floración, y (iii) uso de una nueva tecnología transcriptómica que permitirá un análisis transcriptómico completo de genes para una detección de genes expresados diferencialmente.

Área de conocimiento

Biología vegetal y animal, Ecología, Agricultura, ganadería y pesca,alimen.

Centro de investigación

INRA-Bordeaux

Investigadores o grupo de investigacion con el que colabora

Elisabeth Direlwanger, José Quero, Teresa Barreneche, Bénédicte Wenden, Loïck Le Dantec.

Período de Actividad

01/01/2011 - 01/01/2013

Resultados más destacados del proyecto

He viajado a EEUU para formarme en la utilización de Chip Infinium II para optimizar el genotipado en cerezo. Lo que nos ha permitido caracterizar genéticamente una parte importante del material vegetal con el que trabajamos.

Estamos en proceso de enviar el primer articulo sobre mapeo genético y tenemos otros en marcha sobre identificación de QTL, genes candidatos, y colocación de ambos. Tambien colaboro en la identificacion de QTL asociados al rajado, uno de los principales problemas productivos en cerezo y otras especies frutales.

No obstante, todavía nos queda un año de intenso trabajo.

Principales 5 resultados

Klagges, C., J. A. Campoy, J. Quero-Garcia, A. Guzman, L. Mansur, E. Gratacos, H. Silva, U. R. Rosyara, A. Iezzoni, L. A. Meisel and E. Dirlewanger, 2013: Construction and comparative analyses of highly dense linkage maps of two sweet cherry intra-specific progenies of commercial cultivars. PLoS ONE, 8, e54743-e54743.

Campoy, J. A., D. Ruiz, M. D. Nortes and J. Egea, 2013: Temperature efficiency for dormancy release in apricot varies when applied at different amounts of chill accumulation. Plant biology (Stuttgart, Germany), 15 Suppl 1, 28-35.

Campoy, J. A., D. Ruiz, L. Allderman, N. Cook and J. Egea, 2012: The fulfilment of chilling requirements and the adaptation of apricot (Prunus armeniaca L.) in warm winter climates: An approach in Murcia (Spain) and the Western Cape (South Africa). European Journal of Agronomy, 37, 43-55.

Campoy, J.A.; Ruiz, D.; Egea, J. Effects of shading and thidiazuron + oil treatment on dormancy breaking, flowering and fruit set in apricot in a warm winter climate. Scientia Horticulturae. 2010 doi:10.1016/j.scienta.2010.03.029 (In press) Impact index: 1.197 

Andreini, L., R. Viti, S. Bartolini, D. Ruiz, J. Egea and J. A. Campoy, 2012: The relationship between xylem differentiation and dormancy evolution in apricot flower buds (Prunus armeniaca L.): the influence of environmental conditions in two Mediterranean areas. Trees-Structure and Function, 26, 919-928.

Objetivos científicos alcanzados hasta la fecha

Llevamos adelante una serie de experimentos sobre genes candidatos, expresion diferencial de genes, identificación de QTL, etc. En este segundo año confirmaremos estos resultados. Ya tenemos algunos genes que colocalizan con QTL, que explican parte de nuestra variación fenotípica.

Estancias Anteriores

 Michigan State University. 1 month.

Plant and Food Research (HortResearch) New Zeland. 2009. 2 months. Gene mapping. Key: P

Stellenbosch University. South Africa. 2008. 5 months. Ecophysiology of dormancy. Key: D* W

estern Cape University. South Africa. 2008. 3 months. Gene mapping. Key: D* 4.Stellenbosch University. South Africa. 2007. 4 months. Ecophysiology of dormancy. Key: D

Universitá de Pisa. Italia. 2006. 2 months. Ecophysiology of dormancy. Key: D

East Malling Research. England. 2003. 3 months. Genotyping and phenotyping.

Key: O (LEONARDO DA VINCI GRANT) KEY: D=PhD, P=Postdoctoral, O=others (specify)

Actualmente investiga en la linea

Estudio los factores genéticos y genómicos que están controlan la adaptación climática en cerezo.


Descríbenos tu día a día en el centro

8.00h. Llegada. Comienzo en el laboratorio/oficina (en función de las tareas del día). 10.00 Pausa para el café (que no suelo tomar para adelantar con los emails) 12.30. Comida a la hora francesa 13.15 Vuelta al trabajo. 15.00. Pausa para el café (que tampoco tomo) 17.30-20.00 Hora de salida en función del trabajo que tengamos.

Enlaces a publicaciones o resultados propios

Ya hemos publicado dos comunicaciones a congreso: en Plant and Animal Genome Conference en EEUU en 2012. https://pag.confex.com/pag/xx/webprogram/Session1458.html  (P0496 y P0499); y este año he tenido la oportunidad de asistir personalmente a PAG 2013, para hablar sobre cambio climático y legargo invernal en cerezo: https://pag.confex.com/pag/xxi/webprogram/Paper5014.html

Asimismo, hemos publicado recientemente en PlosOne mapas genéticos de cerezo usando un chip de 6000 SNP, que muestran una gran similitud (sintenia) con melocotón, especie para la que tenemos el genoma completo, y que suponen un gran avance para el estudio del control genético de caracteres de interés agronómico en cerezo:

http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0054743

Actualmente, estamos preparando varios artículos sobre diversos aspectos asociados a la genética y mejora en cerezo.

¿Qué tal es la experiencia, tanto desde un punto de vista científico como personal?

Hasta ahora muy buena. Buen ambiente de trabajo, un proyecto muy interesante, que me està permitiendo formarme en notablemente en genética, mejora y genomica.

A nivel personal, excelente. Me està permitiendo aprender francés y hasta he tenido la oportunidad de colaborar en una asignatura en la Universidad Bordeaux 1.

Defíne el centro en una frase

Dentro de este centro, la unidad donde trabajo estudia la adaptación al cambio climático de distintos cultivos: fresa, nogal, frutales.

Dinos por qué elegistes este centro

Es el único centro a nivel europeo con un equipo multidisciplinar centrado en el estudio de la adaptación climática de cultivos frutales.

Instalaciones

Finca experiemental, laboratorios microarray, plataforma de sequenciación, microscopios electrónicos,...

Investigadores relevantes del centro

Elisabeth Dirlewanger, Beatriz Denoyes-Rothan

¿Sigues un programa formativo en el centro?

Sí, he asistido a cursos de: Genome Wide Selection, software estadístico libre: R (teoría y prácticas), francés, optimización de la publicación de artículos, etc.

Háblanos de tu ciudad, aquello que desees resaltar de ella, que te ha llamado más la atención, lo esencial

1.000.000 de personas en el área metropolitana. Epicentro vinícola y ostreicultor (bahía de Arcachon). Patrimonio Mundial de la UNESCO. Una ciudad agradable.

Y cuando no investigas, ¿qué te ofrece la ciudad para tu tiempo libre?

Deporte, conciertos, naturaleza en los alrededores, catas de vino.

WEB del centro

http://www.bordeaux-aquitaine.inra.fr/

¿Cómo accediste al centro?

A través de ISI Web of Knowlewge, vi sus trabajos y contacté directamente con ellos.

¿Por qué te admitieron, qué tramites seguiste para ello?

Les envié mi CV y les sugerí la posibilidad de colaborar. Les encantó la idea.

¿Qué caracteriza el centro en el ámbito internacional?

Es un centro multidisciplinar, con gran experiencia en genética y genómica de frutales.

¿Qué consejos darías a otros jóvenes investigadores que quieran acudir a este centro?

Contactar directamente con los investigadores y negociar las condiciones de la colaboración, posibles publicaciones, etc.

¿Qué destacarías, qué es lo que consideras más positivo?

El grupo de trabajo: multidisciplinar y con muchos contactos a nivel internaiconal, realizando numerosas colaboraciones con distintos grupos de investigacion. Las posibilidades formacion: genome wide selection, français, R, optimizacion de recursos para la publicacion, etc.

¿Qué resultados esperabas de la estancia? ¿Se están satisfaciendo tus expectativas?

Estoy muy satisfecho con los resultados obtenidos. No solamente hemos avanzado en el estudio de QTL y genes candidatos asociados a floracion, sino que además estamos trabajando en otras líneas muy interesantes, como RNA-seq, expresión diferencial de genes, genética de asociación e incluso genómica funcional.

Es por esto por lo que he sido contratado este año por el INRA. Asímismo, hemos solicitado varios proyectos a nivel nacional e internacional para poder prolongar mi estancia.

Opina sobre algún tema de actualidad o relativo a tu investigación

Cambio climático y adaptación de cultivos

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