Región de Murcia
Fundación Séneca
FSE

Ingenería inversa de los procesos biológicos involucrados en la progresión de la enfermedad de Párkinson a partir de datos ómicos

Nace en Murcia en 1992. En 2014 obtiene el grado en Bioquímica por la Universidad de Murcia. A continuación cursa el máster en "Biología Molecular y Biotecnología" en la Universidad de Murcia obteniendo el título de máster en el año 2015. Entre 2015 y 2019 desarrolló su proyecto de tesis doctoral en el departamento de Anatomía Humana y Psicobiología de la facultad de Medicina de la Universidad de Murcia, bajo la dirección de la Dra. María Trinidad Herrero y en el Department of Psychiatry and Neuropsychology de Maastricht University, bajo la dirección de Dr. Harry Steinbusch, obteniendo el doble grado de doctora en 2019 por la Universidad de Murcia y la Universidad de Maastricht.  Durante el periodo de tesis disfrutó de un contrato de Titulado Superior dentro del Proyecto de Investigación "Neuroprotection in neurodegenerative processes associated with Parkinsonism and aging: correlation between dopaminergic neuronal death and glial inflammatory processes".  Mientras desarrolló la tesis doctoral realizó una estancia investigadora en School for Mental Health and Neuroscience, Faculty of Health, Medicine and Life Science, Deparment of Psychiatry and Neuropsychology, Maastricht University en el año 2018 bajo la supervisión del Dr. Harry Steinbusch.  En el año 2020 obtuvo una beca de la Fundación Séneca para realizar una estancia posdoctoral investigando acerca de la integración de modelos de co-expresión a partir de datos transcriptómicos single-cell para estudiar los mecanismos moleculares implicados en el inicio y la progresión de la enfermedad de Párkinson en University College London (UCL) con la Dra. Mina Ryten. Posee comunicaciones en congresos nacionales e internacionales, así como 11 publicaciones científicas en revistas de carácter nacional e internacional. Domina el inglés y tiene conocimientos francés.


Resumen del proyecto de investigación

Problema socio-económico y desafío científico. Para el año 2030, se estima el diagnóstico de aproximadamente 9 millones de casos con enfermedad de Párkinson, lo que supondrá un impacto económico de billones de euros. Por ello, hay una necesidad inmediata de apoyar la búsqueda de nuevas estrategias terapéuticas que retrasen el inicio y el desarrollo de esta enfermedad.

Avances y limitaciones científicas actuales. Actualmente, los métodos más prometedores para la investigación en enfermedades neurodegenerativas son los estudios de asociación del genoma (GWAS) y los análisis del transcriptoma. Mediante estos estudios se han identificado loci de riesgo relacionados con la edad de inicio o progresión de la enfermedad. El éxito de estos análisis radica en su naturaleza no sesgada que permite identificar nuevos mecanismos involucrados en la enfermedad aunque todavía poseen ciertas limitaciones.

Objetivos de este proyecto. Así, este proyecto tiene como principal objetivo integrar diferentes modelos de co-expresion génica para investigar los mecanismos moleculares involucrados en la progresión de la Enfermedad de Párkinson. Para esta finalidad, planteamos una metodología innovadora basada en la integración de modelos de co-expresión procedentes del análisis transcriptómico masivo y específico de células. El resultado será la creación de una meta-red que nos permitirá (i) describir las interacciones y mecanismos de regulación de los genes de riesgo, (ii) identificar las regiones del cerebro donde se expresan y (iii) determinar las poblaciones celulares de interés. Además, utilizaremos los datos obtenidos para realizar predicciones y validaciones in silico con el objetivo de crear una lista de genes como posibles dianas terapéuticas. En definitiva, el desarrollo de este proyecto mejorará la metodología actual basada en la integración de estos análisis proporcionando nuevas perspectivas en la investigación de los procesos neurodegenerativos de la enfermedad de Parkinson.

Área de conocimiento

Biología molecular, celular y genética, Fisiología y Farmacología, Medicina

Centro de investigación

UCL Queen Square Institute of Neurology

Investigadores o grupo de investigacion con el que colabora

The Ryten Lab es el nombre del grupo de investigación liderado por la Dra. Mina Ryten. Formar parte del grupo me está aportando una característica, desde el punto de vista científico, muy importante: una metodología basada en la colaboración. Desde que comencé el proyecto, todos los miembros del grupo me han ayudado a sentirme totalmente integrada.  La dinámica en el grupo es altamente eficiente y productiva con dos reuniones semanales (lunes/viernes) donde realizamos una valoración de cada proyecto de manera individual.

Para conocer más a los miembros del grupo: Team - RytenLab

Período de Actividad

02/03/2020 - 02/03/2022

Resultados más destacados del proyecto

Los resultados más destacables de los primeros seis meses de proyecto han sido publicados en bioRxiv y, actualmente, se encuentran en proceso de publicación:

  1. CoExp Web, a web tool for the exploitation of co-expression networks.
  2. Modeling multifunctionality of genes with secondary gene co-expression networks in human brain provides novel disease insights.

Objetivos científicos alcanzados hasta la fecha

Gracias a la naturaleza bioinformática de este proyecto, he podido continuar mi formación postdoctoral sin que se haya visto afectada por la crisis sanitaria causada por la Covid-19. Por ello, los objetivos científicos más destacables que he alcanzado:

  1. Colaboración en dos artículos científicos como segunda autora que han sido publicados en bioRxiv.
  2. Familarización con las principales técnicas bioinformáticas y gestión de datos clínicos y transcriptómicos.
  3. He sido aceptada para formar parte del comité ejecutivo de un grupo científico internacional de interés profesional (Neuromodulatory Subcortical Systems, NSS) de la Asociación Internacional de Alzheimer. 
  4. He co-organizado un evento satélite (PIA Day) del Congreso Internacional de la Asociación de Alzheimer celebrado el pasado mes de agosto 2020.
  5. He asistido ha numerosos seminarios y reuniones online celebrados semanalmente tanto por el Ryten Lab como por el Departamento.

Estancias Anteriores

Estacia predoctoral: School for Mental Health and Neuroscience, Faculty of Health, Medicine and Life Science, Department of Psychiatry and Neuropsychology, Maastricht University. La duración de la estancia fue de 9 meses. y estuvo supervisada por el Dr. Harry Steinbusch.

Actualmente investiga en la linea

Neurodegeneración, bioinformática, transcriptómica


Descríbenos tu día a día en el centro

  • -> Por la mañana:
  • Un día normal comienza a las 8.30 h con un café y repasando el correo.
  • Los lunes o viernes, a las 10h (UK time) hay reunión de grupo con valoración de la semana.
  • Los miércoles a las 12h (UK time) hay seminario departamental.
  • 12.30-13.00h: Lunch Break
  • -> Por la tarde:
  • (Sin contar cursos o reuniones puntuales) Concentro mi atención en los análisis o en la lectura de artículos científicos.
  • Al final de la tarde, envío los últimos correos y dejo preparado el plan del día siguiente.
  • 18.00-18.30: Fin de la jornada

Defíne el centro en una frase

UCL Queen Square Institute of Neurology tiene una reputación de clase mundial en neurociencia. Su principal objetivo es trasladar los resultados de la investigación básica en neurociencia al diseño de terapias para pacientes con enfermedades neurológicas.

Dinos por qué elegistes este centro

University College London y, específicamente, UCL Queen Square Institute of Neurology es una de las instituciones de referencia a nivel mundial en Medicina, Genética y Neurociencia. Además, en UCL se encuentra el grupo de investigación liderado por la Dra. Mina Ryten. Desde que conocí a la Dra. Ryten la experiencia ha sido muy positiva fomentando un ambiente científico y familiar entre los miembros del grupo.

Investigadores relevantes del centro

A lo largo de su historia, UCL ha sido lugar de nacimiento de numerosos descubrimientos científicos significativos, con 29 ganadores del Premio Nobel y tres medallas Fields entre estudiantes y personal. Específicamente, en Medicina, Genética y Neurociencia destacan: Prof. Francis Crick (co-descubridor de la estructura del ADN); Prof. Andrew Huxley (descrubió la base para la propagación de los impulsos nerviosos) o Prof. Sir Martin Evans (investigador en modificaciones genéticas en ratones).

Para más información sobre los investigadores galardonados con el Premio Nobel: https://www.ucl.ac.uk/about/who/history/nobel-prize-winners

Como información adicional, también han habido personajes destacables en otros ámbitos, deportes o música: https://www.ucl.ac.uk/about/who/history

¿Sigues un programa formativo en el centro?

Sí, los investigadores postdoctorales en la UCL siguen un programa formativo basado en:

  1. Asistencia semanal y presentación a seminarios organizados por el departamento
  2. Co-dirección de un proyecto de Máster
  3. Investigación en una línea de investigación
  4. Realización de cursos formativos

Háblanos de tu ciudad, aquello que desees resaltar de ella, que te ha llamado más la atención, lo esencial

¿Qué puedo decir de Londres que nadie sepa? Es una ciudad enorme y cosmopolita. La cantidad de eventos, actividades y sitios que visitar es incontable. Sin embargo, la ciudad cambia mucho cuando llegas como turista respecto a cuando llegas como residente. Sorprendentemente, es una ciudad que se abre a ti y te acoge perfectamente. Supongo que habrá diversas experiencias pero la mia es muy buena. Además, tengo la suerte de trabajar a 3 minutos del British Museum, lo cual hace que haya descubierto un poco más en detalle un museo impresionante (recomiendo ver la colección de Egipto). Aunque me pille un poco más lejos (en Londres todo pilla lejos), el Museo de Historia Natural es uno de mis preferidos. La entrada es preciosa y abrumadora (y a pesar de que sea raro, en la propia cafeteria del museo hacen unos scones para morirse). A unos 10 minutos andando del museo, están los Jardines de Kensington y Hyde Park, un lugar perfecto para pasear. Recomiendo ir al mercado de Portobello en Notting Hill y tirarse todo el día viendo lo que pueden llegar a vender y comer unas patatas fritas rizadas, aunque el puesto no te de mucha seguridad (prometo que están muy buenas!). Todavía me quedan mil cosas por descubrir, las últimas el atardecer desde uno de los balcones del Tate Modern Museum o las tiendas en los alrededores de Covent Garden.

Y cuando no investigas, ¿qué te ofrece la ciudad para tu tiempo libre?

Me encanta ir a los museos (como ya he comentado antes), pasear por los parques y tengo planificado hacer ruta de mercados de comida (la variedad es inmensa) e ir al teatro.

WEB del centro

https://www.ucl.ac.uk/ion/

¿Cómo accediste al centro?

Mi creciente interés en la biología de sistemas y el uso de herramientas bioinformáticas durante mi tesis doctoral me llevaron a contactar con el Prof. Juan Antonio Botía (Facultad de Informática, Universidad de Murcia), quien gracias a su estrecha colaboración con el Ryten Lab, me informó de sus diferentes líneas de investigación y me presentó a la Dra. Mina Ryten. 

¿Por qué te admitieron, qué tramites seguiste para ello?

En primer lugar, contacté con la Dra. Mina Ryten que me pidió mi CV para ver si mi perfil encajaba en el grupo. A continuación, tras recibir su aceptación, preparamos y organizamos el proyecto para hacer la estancia postdoctoral.

¿Qué caracteriza el centro en el ámbito internacional?

La UCL es una de las universidades más antiguas en Reino Unido. Pertenece al conocido Golden triangle formados por las universidades británicas más destacadas entre las ciudades de Cambrigde, Londres y Oxford. Cada año, la UCL se encuentra valorada dentro de las 10 mejores universidades del mundo por el QS World University Rankings. A continuación, dejo los enlaces para obtener más información:

  1. Historia de la UCL: https://es.wikipedia.org/wiki/University_College_de_Londres
  2. Golden triangle: https://es.wikipedia.org/wiki/Golden_triangle
  3. Información detallada de la UCL actualmente: https://www.ucl.ac.uk/about/
  4. Link al QS World University Rankings: https://www.topuniversities.com/university-rankings/world-university-rankings/2020

¿Qué consejos darías a otros jóvenes investigadores que quieran acudir a este centro?

La UCL es una institución de referencia en muchos campos científicos. Además, la gestión en los departamentos es impecable y el ambiente en los grupos de investigación es de cooperación. La oferta en cursos, seminarios y charlas es constante y de diversos temas. Además se encuentra en Londres, una ciudad con una actividad frenética llena de lugares que visitar. En definitiva, recomiendo hacer una estancia si se tiene la oportunidad.

¿Que estas haciendo?

Actualmente, estoy utilizando técnicas bioinformáticas basadas en la integración de datos transcriptómicos y datos clínicos de pacientes con Enfermedad de Párkinson.

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